截止2006年年底，张家港市档案馆共保存158个全宗的档案。由于1962年才建县，故馆藏档案基本上为中华人民共和国建国后的档案，这些档案较为全面地记载了沙洲县（1962-1986）、张家港市的概况概貌、自然、经济、文化、风俗等方面的发展与变化情况，真实地反映了张家港市人民群众在党的正确领导下进行社会主义革命和建设的业绩。建县前有关反映本县历史面貌的档案除保存在江阴、常熟两市档案馆外，还散存在苏州、南通、上海等地的档案馆及中国第二历史档案馆内。
    目前，馆藏档案有文书档案、专门档案、科技档案、特殊载体档案、实物档案。主要来源于县、市党政领导机关及其所属部、委、办、局、临时机构、群众团体和镇级机关、部分企事业单位。在档案进馆方式上，一是采取定期接收（在档案室保存满8-10年的永久、长期档案）；二是对撤销单位的档案随时接收。
    馆内有153个全宗含有文书档案，共计120320卷，18635件。主要内容涉及计划总结、会议记录、会议材料、机构设置、干部任免、干部职工工作分配、调动、转正定级、离退休、调资、保险、考核、奖惩方面的介绍信、审批表等、人事及业务统计年报、史志、大事记、党和国家、各部门有关业务工作的法规、规定、复退军人、土地改革档案。
    科技、专门档案主要有：基建（道路、长江防洪工程、重要公共建筑）、产品、婚姻、农科、纪检监察、工商歇业登记、公证、资源调查（含测绘）、统计普查、会计、宣传报道、死亡干部档案，共14类，共计32198卷。
    特殊载体档案：主要是照片、录音、录像、光盘档案。照片档案共有5863张，记载的主要内容有：一是张家港市党代会、人代会、政治协商会、团代会、重要专门会议的照片；二是党和国家领导人（江泽民、李鹏、胡耀邦等）视察张家港市、国际国内友好往来（联合国经济考察团、孟加拉国、柬埔寨等国的代表团）、知名人士来我市的照片。录音录像档案共有93盒，光盘档案109盘，主要内容有领导视察、全市重要会议、抗洪救灾、沙洲工学院简介等。
    实物档案：党和国家领导人、知名人士的题词、张家港市获得的国家级荣誉证书、奖杯、奖牌等733件。
    馆藏资料主要是报纸、杂志、图书，共10706册，主要来源是征集、接收、购买等途径。报纸有《人民日报》、《解放日报》、《文汇报》、《新华日报》等15种；杂志有党建、经济、法制、档案工作等10大类；图书有政治、哲学、经济、历史、地方志等12类。重要的资料有：《大桥张氏宗谱》、《杨舍堡城志》、《重修常昭合志》、《江阴续志》等。